Witamy!

Seminarium robocze Biologia Obliczeniowa i Bioinformatyka odbywa się w

budynku Wydziału MIM UW,
przy ulicy Banacha 2 (wejście od Pasteura),
w sali 5820,
w środy w godzinach 10:15-11:45.

Zapraszają:

Bartek Wilczyński i Jerzy Tiuryn (Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki, Uniwersytet Warszawski) (tiuryn@mimuw.edu.pl)

Najbliższe spotkanie:

• 16.05.2012, Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) Widespread cooperative binding of mammalian transcription factor complexes in vivo

Poprzednie seminaria

• 09.05.2012, Michał Woźniak (MIM UW) Kombinatoryczne stosowanie leków: przegląd literatury i baz danych
• 25.04.2012, Michał Startek (MIM UW) O transpozonach raz jeszcze
• 18.04.2012, Paweł Górecki (MIM UW) O uzgadnianiu drzew raz jeszcze
• 04.04.2012, Robert Szczelina (Instytut Informatyki UJ) Mocne i słabe strony metod rekonstrukcji sieci zależności genowych
• 28.03.2012, Magdalena Kroteń (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) Histon łącznikowy H1 u Arabidopsis thaliana
• 21.03.2012, Michał Woźniak (MIM UW) Evolution of drug resistance and compensatory mutations: literature review
• 14.03.2012, Piotr Dittwald (MIM UW) Inverted low-copy repeats and genome instability – a genome-wide approach
• 07.03.2012, Aleksander Jankowski (MIM UW) Nowe techniki badania dostępności chromatyny: przegląd literatury
• 29.02.2012, Bartek Wilczyński (MIM UW) Jak reprezentować stan chromatyny w komputerze: przegląd literatury
• 22.02.2012, Jerzy Tiuryn (MIM UW) Ogólne podejście do uzgadniania drzew genów z drzewami gatunków
• 15.02.2012, Przemysław Biecek (MIM UW) Przedstawienie pracy „Detecting Novel Associations in Large Data Sets”, David N. Reshef et al., Science (2011)
• 18.01.2012, Norbert Dojer (MIM UW) Efektywne mapowanie odczytów z sekwencera zawierających błędy
• 11.01.2012, Aleksander Jankowski (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych
• 04.01.2012, Piotr Dittwald (MIM UW) Modelowanie danych spektrometrycznych (algorytm do liczenia obwiedni izotopowych)
• 21.12.2011, Marta Prymakowska-Bosak (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) Analiza globalnych zmian transkryptomu komórek T87 Arabidopsis thaliana w odpowiedzi na stres abiotyczny
• 14.12.2011, Michał Komorowski (Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN) Statistics for dynamical models of biochemical systems
• 07.12.2011, Michał Woźniak (MIM UW) Predykcja oporności na antybiotyki w bakteriach na podstawie sekwencji genomowych
• 30.11.2011, Paweł Górecki (MIM UW) Nowe algorytmy dla uzgadniania nieukorzenionych drzew genów i ukorzenionych drzew gatunków
• 23.11.2011, Michał Dąbrowski (Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN) Baza danych TRAM – łatwy dostęp i integracja danych użytkownika z Ensembl funcgen
• 16.11.2011, Teresa Przytycka (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, Maryland, USA) Toward bridging the gap between genotype and phenotype – systems biology approach
• 09.11.2011, Bartek Wilczyński (MIM UW) Chwytanie obszarów regulatorowych na gorącym uczynku w sieci Bayesowskie
• 02.11.2011, Michał Woźniak (MIM UW) CAMBer: an approach to support comparative analysis of multiple bacterial strains
• 26.10.2011, Aleksander Jankowski (MIM UW) Predicting cell type-specific transcription factor cooperative binding
• 19.10.2011, Łukasz Bieniasz-Krzywiec (MIM UW) Odtwarzanie interakcji chromatyny na podstawie danych o modyfikacjach histonów
• 12.10.2011, Wiesława Widłak (Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów, Instytut Onkologii, Oddział w Gliwicach) Komórkowo-swoisty mechanizm apoptozy indukowanej przez stres
• 05.10.2011, Ewa Szczurek (Max Planck Institute for Molecular Genetics) Modeling genetic interactions in cancer