Witamy !

Seminarium robocze Matematyczne Metody Biologii odbywa się w

budynku Wydziału MIM UW,
przy ulicy Banacha 2 (wejście od Pasteura),
w sali 5820 (zmiana sali),
w środy w godzinach 10:15-11:45.

Zaprasza:

Jerzy Tiuryn (Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki, Uniwersytet Warszawski)

(tiuryn@mimuw.edu.pl)

Najbliższe spotkanie:

• 4.06.2008, Anna Gambin (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.

Po seminarium zapraszamy na herbatę, kawę i ciastka.

Poprzednie seminaria

• 28.05.2008, Maciej Sykulski (MIM UW) Ziarna białkowe: alfabety i zastosowanie w algorytmie BLAST.
• 21.05.2008, Paweł Górecki (MIM UW) Sieci filogenetyczne: modelowanie i rekonstruowalność.
• 14.05.2008, Mikołaj Rybiński (MIM UW) Selekcja modeli aktywacji receptora szlaku sygnałowego JAK-STAT.
• 7.05.2008, Bogusław Kluge (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 23.04.2008, Przemysław Biecek (MIM UW oraz Uniwersytet Wrocławski) Analiza sekwencji DNA w pobliżu miejsca terminacji translacji w różnych prokaryotach.
• 16.04.2008, Norbert Dojer (MIM UW) Algorytm Pearl'a dla sieci Bayesowskich.
• 9.04.2008, Norbert Dojer (MIM UW) Sieci Bayesowskie - wprowadzenie.
• 2.04.2008, Damian Wójtowicz (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 19.03.2008, Paweł Górecki (MIM UW) O dokładnej rekonstrukcji drzew genów z całych genomów.
• 12.03.2008, Damian Wójtowicz (MIM UW) Przegląd metod obliczeniowych do przewidywania oddziaływań domena-domena.
• 5.03.2008, Mikołaj Rybiński (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 27.2.2008, Damian Wójtowicz (MIM UW) Przewidywanie interakcji białko-białko i domena-domena - podejście obliczeniowe (przegląd).
• 20.2.2008, Norbert Dojer (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 23.1.2008, Bogusław Kluge (MIM UW) Markowowski model aktywności egzopeptydaz - kontynuacja.
• 16.1.2008, Bogusław Kluge (MIM UW) Markowowski model aktywności egzopeptydaz.
• 9.1.2008, Janusz Dutkowski (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 19.12.2007, Piotr Pokarowski (MIM UW) Rozkład spektralny macierzy kwadratów odległości z zastosowaniami w biologii strukturalnej - kontynuacja.
• 12.12.2007, Przemysław Biecek (MIM UW i IM PAN oddzial we Wrocławiu) Zastosowania statystyki i informatyki w genomice i badaniach dynamiki populacji.
• 5.12.2007, Paweł Górecki (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 28.11.2007, Jerzy Tiuryn (MIM UW) Struktura przestrzeni drzew z relacją sąsiedztwa NNI.
• 21.11.2007, Piotr Pokarowski (MIM UW) Rozkład spektralny macierzy kwadratów odległości z zastosowaniami w biologii strukturalnej.
• 14.11.2007, Ewa Szczurek (MIM UW oraz Max Planck Institute Berlin) Projektowanie eksperymentów perturbacyjnych w sieciach sygnalizacyjnych i znajdowanie modułów regulacji genów.
• 7.11.2007, Bartek Wilczyński (MIM UW) Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych.
• 24.10.2007, Janusz Dutkowski (MIM UW) Przewidywanie interakcji białko-białko - podejście ewolucyjne (c.d.).
• 17.10.2007, Janusz Dutkowski (MIM UW) Przewidywanie interakcji białko-białko - podejście ewolucyjne.
• 10.10.2007, Anna Gambin (MIM UW) Identyfikacja transpozonów typu PIF/Harbinger w genomie Medicago Trancatula.
• 3.10.2007, Jerzy Tiuryn (MIM UW) Omówienie pewnych prac z konferencji ECCB/ISMB, Wiedeń, 2007.
• 6.6.2007, Przemysław Świtalski i Krzysztof Zalewski (MIM UW) Analiza danych mikromacierzowych, część 2. plik1 plik2
• 30.5.2007, Jakub Mieczkowski i Piotr Pokarowski (MIM UW) Analiza danych mikromacierzowych, część 1.
• 23.5.2007, Bartek Wilczyński (IM PAN oraz MIM UW) Omówienie najciekawszych prac z konferencji RECOMB 2007.
• 16.5.2007, Bogusław Kluge (MIM UW) Przeszukiwanie przestrzeni drzew filogenetycznych - kontynuacja.
• 9.5.2007, Bogusław Kluge (MIM UW) Przeszukiwanie przestrzeni drzew filogenetycznych.
• 25.4.2007, Paweł Stankiewicz (Zakład Genetyki Medycznej, Instytut Matki i Dziecka) Identyfikacja architektury genomu odpowiedzialnej za powstawanie chorób genomowych.
• 18.4.2007, Jerzy Tiuryn (MIMUW) Przegląd pewnych nowych wyników w bioinformatyce.
• 4.4.2007, Norbert Dojer (MIMUW) Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych - kontynuacja.
• 14.3.2007, Norbert Dojer (MIMUW) Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych - kontynuacja.
• 7.3.2007, Norbert Dojer (MIMUW) Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych.
• 28.2.2007, Ewa Szczurek (Max Planck Institute Berlin oraz MIMUW) Modelowanie sieci sygnalizacyjnych w rachunku pi.
• 21.2.2007, Anna Gambin (MIMUW) CTX-BLAST - kontekstowa wersja algorytmu BLAST.
• 24.1.2007, Mikołaj Rybiński (MIMUW) Modelowanie i weryfikacja komórkowych szlaków sygnałowych. (dokończenie)
• 17.1.2007, Mikołaj Rybiński (MIMUW) Modelowanie i weryfikacja komórkowych szlaków sygnałowych.
• 10.1.2007, Bartek Wilczyński (IM PAN i MIMUW) Odtwarzanie stochastycznych sieci logicznych z danych mikromacierzowych.
• 20.12.2006, Piotr Pokarowski (MIMUW) EM dla bayesowskiego modelu hierarchicznego Szymona Nowakowskiego. - kontynuacja
• 13.12.2006, Piotr Pokarowski (MIMUW) EM dla bayesowskiego modelu hierarchicznego Szymona Nowakowskiego.
• 6.12.2006, Bogusław Kluge (MIMUW) Hierarchiczne klastrowanie stanów łańcucha Markowa.
• 29.11.2006, Janusz Dutkowski (MIMUW) Odtwarzanie sieci interakcji białko-białko u wspólnego przodka gatunków.
• 22.11.2006, Janusz Dutkowski (MIMUW) Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja)
• 15.11.2006, Janusz Dutkowski (MIMUW) Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja)
• 8.11.2006, Janusz Dutkowski (MIMUW) Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja)
• 1.11.2006, Dzień wolny
• 25.10.2006, Janusz Dutkowski (MIMUW) Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko.
• 11.10.2006, Damian Wójtowicz (MIMUW) Analiza ewolucji genomów. (kontynuacja)
• 4.10.2006, Damian Wójtowicz (MIMUW) Analiza ewolucji genomów.