| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 12.06.2024 | Transformation of variation graphs into whole genome alignment graphs | Anna Lisiecka (MIM UW) | |
| 05.06.2024 | Uncertainty propagation of MC-ICP-MS measurement methods | Piotr Radziński (MIM UW) | |
| 29.05.2024 | Promoter structure-based gene classification | Konrad Łukaszyk (CeNT UW) | |
| 22.05.2024 | Invertible Bloom lookup tables and their (possible) applications to genomics | Gregory Kucherov (CNRS & Gustave Eiffel University) | |
| 15.05.2024 | NMR spectroscopy: challenges and solutions using optimal transport theory | Barbara Domżał (MIM UW) | |
| 08.05.2024 | Discovering Spatial Tissue Landscapes using Cellohood Model | Marcin Możejko (MIM UW) | |
| 24.04.2024 | Unifying duplication episode clustering and gene-species mapping inference | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 17.04.2024 | Towards efficient data-driven biomonitorning and bioprospectin | Przemysław Decewicz (Faculty of Biology, UW) | |
| 10.04.2024 | Recovering complex chromosomal rearrangements from karyotype graphs | Barbara Poszewiecka (MIM UW) | |
| 20.03.2024 | Joint cell type identification in spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing data | Agnieszka Geras (MiNI PW and MIM UW) | |
| 13.03.2024 | Phylogenetic network inference | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 06.03.2024 | On some applications of Wasserstein metric in analysis of spectrometry data | Michał Startek (MIM UW) | |
| 28.02.2024 | Cellohood: marker based modelling of the cellular neighborhoods | Marcin Możejko (MIM UW) | |
| 10.01.2024 | Learning to rank and experiment prioritization | Grzegorz Preibisch (Deepflare and MIM UW) | |
| 20.12.2023 | Molecular signature of primate astrocytes reveals pathways and regulatory changes contributing to the human brain evolution | Aleksandra Pękowska (Nencki Institute of Experimental Biology) | |
| 13.12.2023 | Statistical methods in clinical trials with focus on Bayesian borrowing | Magda Markowska (MIM UW) | |
| 06.12.2023 | Unveiling Microbial Dark Matter: leveraging computational approaches for understanding the unseen world | Anna Karnkowska (Faculty of Biology, UW) | |
| 22.11.2023 | From de Bruijn graphs to variation graphs – relationships between pangenome models | Adam Cicherski (MIM UW) | |
| 15.11.2023 | Macrophage stories: How aging and inflammation shape alveolar macrophage function | Alexander Misharin (Northwestern University, Chicago) | |
| 08.11.2023 | Deciphering enhancer regulatory code for medical genetics | Maria Bochenek (MIM UW) | |
| 25.10.2023 | Association plots and data integration | Marcin Wierzbiński (MIM UW) | |
| 18.10.2023 | Explanatory Model Analysis | Przemysław Biecek (MIM UW and MiNI PW) | |
| 11.10.2023 | Overview of deep learning approaches to non-coding regulatory DNA | Bartek Wilczyński (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 14.06.2023 | Handcuffs and lassos in proteins in ideal polymers | Bartosz Ambroży Greń (CeNT UW) | |
| 07.06.2023 | ML for Protein Secondary Structure Assignments | Mohammad Saqib (Faculty of Chemistry, UW) | |
| 31.05.2023 | A comparative regulomics method for studying gene regulatory evolution | Torgeir R. Hvidsten (Norwegian University of Life Sciences) | |
| 24.05.2023 | Magnetstein: universal tool for complex mixture analysis in NMR spectroscopy | Barbara Domżał (MIM UW) | |
| 17.05.2023 | Deciphering single cells niche composition and their effect on hair follicle and dermal papillae Stem Cells regulation during the hair regeneration cycle | Konrad Łukaszyk (CeNT UW) | |
| 10.05.2023 | Approaching the hydrophobic-polar (HP) protein folding model with the Monte Carlo Method and A* algorithm | Marcin Wierzbiński (MIM UW) | |
| 26.04.2023 | CaClust: mapping cells to the clonal structure in Follicular Lymphoma | Kazimierz Oksza-Orzechowski (MIM UW) | |
| 19.04.2023 | DelSIEVE: joint inference of single-nucleotide variants, deletions, and cell phylogeny from single-cell DNA sequencing data | Senbai Kang (MIM UW) | |
| 12.04.2023 | AI/ML in Polish healthcare system: current opportunities and challenges | Jan Poleszczuk (Institute of Biocybernetics and Biomedical Engineering PAS and Maria Sklodowska-Curie National Research Institute of Oncology) | |
| 05.04.2023 | CABS-flex as a de novo structure prediction tool for cyclic peptides | Karol Wróblewski (CNBCh UW) | |
| 29.03.2023 | Delineating interactions between mutational signatures, cellular processes, and environment through computational approaches | Teresa Przytycka (National Library of Medicine/National Institutes of Health) | |
| 22.03.2023 | Divide & Control: An Efficient Decomposition-based Approach Towards the Control of Asynchronous Boolean Networks | Andrzej Mizera (MIM UW) | |
| 15.03.2023 | CONSET: joint copy number and single nucleotide variant event tree model of evolutionary tumor history for single-cell data | Magda Markowska (MIM UW) | |
| 08.03.2023 | On the Implications of the Simplicity Bias in Deep Nets for the “AI Scientist”: The Good, The Bad, and The Ugly | Stanisław Jastrzębski (Molecule.one) | |
| 01.03.2023 | Analysis of trans-homolog chromatin interactions based on Hi-C data | Magdalena Machnicka (MIM UW) | |
| 25.01.2023 | The interkingdom gene transfer in 44 basal fungi and the open problems in large scale phylogenetic studies of horizontal gene transfer | Michał Ciach (MIM UW) | |
| 18.01.2023 | A novel probabilistic model for cell type identification in spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing data | Agnieszka Geras (MiNI PW and MIM UW) | |
| 11.01.2023 | From 48 to 46 chromosomes: a novel targeted assembler of segmental duplications unravels the complexity of the HSA2 fusion | Barbara Poszewiecka (MIM UW) | |
| 21.12.2022 | Set and graph auto-encoders for the IMC data | Marcin Możejko (MIM UW) | |
| 14.12.2022 | AlphaFold2 from the engineering perspective | Szymon Nowakowski (MIM UW) | |
| 07.12.2022 | Rooting gene trees via phylogenetic networks (COCOON 2022 paper with N. Rutecka and J. Tiuryn) | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 30.11.2022 | Deep Learning for Drug Discovery at NVIDIA | Marta Stępniewska-Dziubińska (NVIDIA) | |
| 23.11.2022 | Modelling the impact of Hypoxia Inducible Factors binding on gene expression in human endothelial cells during hypoxia | Aleksandra Cabaj (Nencki Institute of Experimental Biology) | |
| 16.11.2022 | The impact of negative data sampling on antimicrobial peptide prediction | Michał Burdukiewicz (Autonomous University of Barcelona) | |
| 09.11.2022 | Deep optimized generation methods and models for antimicrobial peptide discovery (mock ERC interview) | Ewa Szczurek (MIM UW) | |
| 26.10.2022 | "Association Plots" and joint clustering and embedding of genes and cells | Martin Vingron (Max Planck Institute for Molecular Genetics) | |
| 19.10.2022 | Ideas on the isotope ratio measurements by MC-ICP-MS: Elimination of isotope standard | Jakub Karasiński (CNBCh UW) Piotr Radziński (MIM UW) | |
| 12.10.2022 | Alignstein: optimal transport and retention time alignment | Grzegorz Skoraczyński (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 05.06.2019 | Matrix Completion Methods for Drug-Target Interaction Prediction | Krisztian Buza (Department of Data Science and Engineering, Eötvös Lorand University) | |
| 29.05.2019 | Elucidating The Dynamics Of Transcriptional Regulation In Cardiomyocyte | Maciej Migdał (International Institute of Molecular and Cell Biology) | |
| 22.05.2019 | Learning signaling networks from combinatorial perturbations by exploiting siRNA off-target effects | Ewa Szczurek (MIM UW) | |
| 15.05.2019 | Multiple duplication events - models and scoring functions | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 08.05.2019 | Automated prediction of fragmentation scheme during CID | Grzegorz Skoraczyński (MIM UW) | |
| 24.04.2019 | Exploring synthetic lethal interactions in cancer | Magdalena Grynkiewicz (MIM UW) | |
| 17.04.2019 | Compressed indexes of biological sequences | Katarzyna Jabłonowska (MIM UW) | |
| 10.04.2019 | Towards pan-genome visualization and structural analysis | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 03.04.2019 | Using unsupervised machine learning in genomics and proteomics | Neo Christopher Chung (MIM UW) | |
| 27.03.2019 | Many probabilistic models are better than one: a new look into genomic/metagenomic data and functional annotation | Alessandra Carbone (Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative, Sorbonne Université-CNRS) | |
| 20.03.2019 | A mathematical model to infer tumor evolutionary history from single-cell DNA sequencing data | Senbai Kang (MIM UW) | |
| 13.03.2019 | Inferring clonal evolution of tumors from Special Transcriptomics and bulk DNA sequencing data | Shadi Darvish Shafighi (MIM UW) | |
| 06.03.2019 | Modelling of the breadth of expression from promoter architectures identifies pro-housekeeping transcription factors | Łukasz Huminiecki (IGHZ PAN) | |
| 27.02.2019 | Deriving statistical potential for RNA 3D structure prediction | Michał Boniecki (IIMCB) | |
| 23.01.2019 | Identification of long range chromatin contacts in Hi-C maps | Irina Tuszynska (MIM UW) | |
| 16.01.2019 | Inferring time consistent and well supported horizontal gene transfers | Agnieszka Mykowiecka (MIM UW) | |
| 09.01.2019 | Improving mapping with contigs assembly | Anna Macioszek (MIM UW) | |
| 19.12.2018 | Modeling drug efficacy in cancer | Krzysztof Koras (MIM UW) | |
| 12.12.2018 | Glioma brain regulatory atlas construction and characterization | Magdalena Machnicka (MIM UW) | |
| 05.12.2018 | Differential analysis of Hi-C data | Rafał Zaborowski (MIM UW) | |
| 28.11.2018 | Application of modern sequencing technologies in detection and clinical evaluation of structural variants | Barbara Poszewiecka (MIM UW) | |
| 21.11.2018 | Finding differentially expressed sequences in metatranscriptomic data | Julia Herman-Iżycka (MIM UW) | |
| 14.11.2018 | Matrix decomposition methods in the context of transcriptomic data | Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 07.11.2018 | Modeling cell metabolism using linear programming and Petri Nets | Grzegorz Bokota (MIM UW) | |
| 31.10.2018 | Transactivation domains in proteins & future plans for MIM UW work | Łukasz Kozłowski (MIM UW) | |
| 17.10.2018 | Genome-wide real-time in vivo transcriptional dynamics during Plasmodium falciparum blood-stage development | Neo Christopher Chung (MIM UW) | |
| 17.10.2018 | The Wasserstein Distance As A Dissimilarity Measure For Tandem Mass Spectra | Michał Ciach (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 23.05.2018 | Solving the interacting paralogue problem by sequence coevolution | Aleksandra Jarmolińska (CENT and MIM UW) | |
| 16.05.2018 | Exploring synthetic lethality and gene dependence in cancer cell line and cancer patient data | Magdalena Budzińska (MIM UW) Magdalena Grynkiewicz (MIM UW) | |
| 09.05.2018 | TADeus - tool for clinical evaluation of chromosomal rearrangements that alter chromatin organization | Barbara Poszewiecka (MIM UW) | |
| 25.04.2018 | Automated Study of Gene Regulatory Networks via Regulatory Modules | Clémence Réda (MIM UW) | |
| 18.04.2018 | Cerebral microbleeding identification via convolutional neural network and advanced pooling techniques | Yudong Zhang (Department of Informatics, University of Leicester) | |
| 11.04.2018 | Mapping and comparing huge sequencing data | Sebastian Deorowicz (Silesian University of Technology) | |
| 04.04.2018 | A review of selected topics from mass spectrometry and organic chemistry (part I) | Michał Ciach (MISDoMP) | |
| 21.03.2018 | A review of selected topics from mass spectrometry and organic chemistry (part I) | Michał Ciach (MISDoMP) | |
| 07.03.2018 | The mode a'posteriori in the Chinese Restaurant Process model - a tasty, bayesian method for clustering | Łukasz Rajkowski (MIM UW) | |
| 28.02.2018 | Predictive modeling and optimization of drug combinations | Katarzyna Jabłonowska (MIM UW) | |
| 24.01.2018 | Modeling drug efficacy in cancer | Krzysztof Koras (MIM UW) | |
| 17.01.2018 | Multi-class texture analysis in colorectal cancer histology using Deep Learning and Variational uncertainty estimation | Marcin Możejko (MIM UW) | |
| 10.01.2018 | De-novo DNA assembly for repeating sequences | Robert Nowak (Warsaw University of Technology) | |
| 20.12.2017 | Functional impact of structural rearrangements on chromatin organization and transcriptional regulation | Aleksander Jankowski (EMBL, Heidelberg) | |
| 13.12.2017 | Unbiased estimation of allelic expression from RNA-seq | Szymon Kiełbasa (Leiden University Medical Center) | |
| 06.12.2017 | Phylogenetic mediantrees | Oliver Eulenstein (Iowa State University) | |
| 29.11.2017 | Mining cancer genomic data | Ewa Szczurek (MIM UW) | |
| 22.11.2017 | Unsupervised methods in the analysis of single cell transcriptomic data - review | Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 15.11.2017 | An algebraic characterization of deep coalescence | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 08.11.2017 | Biologically sound formal model of heat shock response in HeLa cells | Weronika Wronowska (Faculty of Biology UW) | |
| 25.10.2017 | Where mathematical theory meets biological mystery: protein knots and links | Aleksandra Jarmolińska (CeNT UW) and Wanda Niemyska (MIM UW) | |
| 18.10.2017 | Efficient mass-sampling from descrete distributions | Michał Startek (MIM UW) | |
| 11.10.2017 | SimRNA: a Coarse-Grained Method for RNA Folding Simulations and 3D Structure Prediction | Michał Boniecki (International Inst. of Mol. and Cell Biol.) | |
| 04.10.2017 | All participants Short organizational meeting |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 07.06.2017 | New results on gene duplications | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 31.05.2017 | On transcriptomic and metabolomic data analysis - bladder cancer case study | Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 24.05.2017 | DNA methylation impact on the glioma patients overall survival | Michał J. Dąbrowski (IPI PAN) | |
| 17.05.2017 | Deconvoluting Amounts of Stuff Knowing Some Things about Them Using Hype Bayesian Magic and How It Can be Used To Analyze Mass Spectrometry Data | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 10.05.2017 | Separating evolutionary histories of different loci in a gene tree | Michał Ciach (MIM UW) | |
| 26.04.2017 | Epistasis in genomic and survival data of cancer patients | Dariusz Matlak (MIM UW) | |
| 12.04.2017 | Genome-wide modelling of cell-type specific gene expression patterns in Drosophila | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 05.04.2017 | Challenges of formal modelling of chromatin openness and TF binding from DNase-seq data using probabilistic graphical networks | Agata Charzyńska (Nencki Institute) | |
| 29.03.2017 | Life as computation | Sara Jane Dunn (Microsoft Research Cambridge) | |
| 22.03.2017 | Approximating algorithms on semirings by extrapolating moments via fast algorithms on Lp spaces | Olivier Serang (Institute of Computer Science / Freie Universität Berlin) | |
| 15.03.2017 | Restoring biological information from high resolution microscopy | Grzegorz Bokota (MIM UW, CENT) | |
| 08.03.2017 | Chromatin - structure and functions | Jacek Patryn (MISDoMP) | |
| 01.03.2017 | Metody komputerowe przewidywania struktury białek | Magdalena Mozolewska (IPI PAN) | |
| 25.01.2017 | Reproducibility in Biomedical Sciences - Big Data perspective | Wladek Minor (University of Virginia, School of Medicine) | |
| 18.01.2017 | k-mer-based analysis of microbiome RNA-seq data | Julia Herman-Iżycka (MIM UW) | |
| 11.01.2017 | Efficient Algorithms for Genomic Duplication Models | Jarosław Paszek (MIM UW) | Inferring gene-species assignments in the presence of horizontal gene transfer | Agnieszka Mykowiecka (MIM UW) |
| 21.12.2016 | Christmas wishes, poppy-seed cake and cheesecake! | All Participants (MIM UW and friends) | |
| 14.12.2016 | SVM tree kernels for prediction of organic reaction yields | Grzegorz Skoraczyński (MIM UW) | |
| 07.12.2016 | Statistical significance of Tanimoto/Jaccard similarity coefficients to compare binary fingerprints | Neo Christopher Chung (MIM UW) | |
| 30.11.2016 | Tracing nucleosomal organization - accessible occupancy and cell-dependent expression of histone variants | Jakub Mieczkowski (Neurobiology Center, Nencki Institute of Experimental Biology) | |
| 23.11.2016 | ETDetective: Cleavage scene investigation | Michał Ciach (MIM UW) | |
| 16.11.2016 | CONSTANd: A Normalization Method for Isobaric Labeled Spectra by Constrained Optimization | Dirk Valkenborg (Hasselt University/VITO, Belgium) | Masstodon: a tool for modeling electron transfer reactions in mass spectrometry-based protein analysis | Frederik Lermyte (Antwerp University, Belgium) |
| 09.11.2016 | Comparing gene and species trees: overview of recent results | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 02.11.2016 | Multi-scale analysis of the mechanism of C2 ceramide induced cell death | Weronika Wronowska (Faculty of Biology, UW) | |
| 26.10.2016 | On the influence of environmental pressure on transposable elements dynamics - experimental and computational study | Agnieszka Gromadka (MIM UW) Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 19.10.2016 | Challanges of modern chemoinformatics | Michał Startek (MIM UW, IChO PAN) | |
| 12.10.2016 | Energy partitioning during plant growth and acclimation | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 05.10.2016 | Interaction within co-chaperon system | Magdalena Mozolewska (IPI PAN) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 20.05.2016 | Powstanie złożonych komórek eukariotycznych, czyli czego można się dowiedzieć dzięki bioinformatycznej analizie metagenomu z dna oceanu | Katarzyna Zaremba-Niedźwiedzka (Biomedical Centre, Uppsala University) | |
| 18.05.2016 | Cellular model for analysis of complex gene interactions during transcriptional response of plants to environmental stress | Anna Fogtman (IBB PAN) | |
| 11.05.2016 | Describing tertiary RNA structure with local spatial motifs | Agnieszka Mykowiecka (MIM UW) | |
| 04.05.2016 | Seminar cancelled | ||
| 27.04.2016 | From explicit to implicit solvent models: dealing with pecullar hydration effects | Piotr Setny (MIM UW) | |
| 20.04.2016 | Selected approaches for developing miRNA, mRNA and methylation signatures with application to the TCGA data | Kornel Kiełczewski (MiNI PW) | |
| 13.04.2016 | Computational methods in mass spectrometry and chemoinformatics | Michał Startek (MIM UW) | |
| 06.04.2016 | Mixture Gaussian Markov Fields in applications | Maciek Sykulski (WUM) | |
| 30.03.2016 | Inferring molecular processes heterogeneity from transcriptional data | Krzysztof Gogolewski (MIM UW) Weronika Wronowska (MIM UW) | |
| 23.03.2016 | Białka przy powierzchniach | Marek Cieplak (IF PAN) | |
| 16.03.2016 | A challange of a priori classification of organic reactions yields and duration | Grzegorz Skoraczyński (MIM UW) | |
| 09.03.2016 | Clip-Seq data analysis methods | Magda Machnicka (MIM UW) | |
| 02.03.2016 | Stimulation of pro-metastatic properties of ovarian cancer cells | Agnieszka Lech (MiSDoMP) | |
| 03.02.2016 | Seminar cancelled due to the winter exams session | ||
| 27.01.2016 | Ion, like a lion, in Zion: on inferring ion-ion reaction constants in Mass Spectrometry | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 20.01.2016 | Discrete reactive systems and pest control | Marcin Przybyłko (MIM UW and ERIM UNC) | |
| 13.01.2016 | Analysis of the gut microflora of mice | Ilona Grabowicz (MIM UW) | |
| 07.01.2016 | Analysis of chromatin organization using Hi-C data | Aleksander Janowski (EMBL Heidelberg) | |
| 16.12.2015 | Modeling tissue-specific gene regulation | Paweł Bednarz (MIM UW) | |
| 09.12.2015 | Genomic duplication problems for unrooted gene trees | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 02.12.2015 | Deconvoluting off-target confounded RNA interference screens | Ewa Szczurek (MIM UW) | |
| 25.11.2015 | Multiscale analysis of ceramide influence on neuroblastoma cell lines | Weronika Wronowska (Wydział Biologii UW) Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 18.11.2015 | Chromatin structure based on Monte Carlo simulations and String and Binders Switch model | Irina Tuszyńska (MIM UW) | |
| 11.11.2015 | Non-working day: National Independence Day | ||
| 04.11.2015 | Identification of enhancers and distinguishing them from promoters - a machine learning approach | Julia Herman-Iżycka (MIM UW) | |
| 28.10.2015 | Statistical Inference of Variables Driving Systematic Variation in Large-Scale Genomics Data | Neo Christopher Chung (Wroclaw University of Life Science) | |
| 21.10.2015 | Comparative analysis of Hi-C contact maps | Rafał Zaborowski (MIM UW) | |
| 14.10.2015 | 3D Genome organization and Gene Transcription Regulation in Human Cell. Note: Seminar will take place in lecture hall 00.142, CeNT I building, Banacha 2c street, at 10:00 o'clock | Yijun Ruan (The Jackson Laboratory for Genomic Medicine) | |
| 07.10.2015 | Top-down or bottom-up? On segmentation of Hi-C contact matrices | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 30.09.2015 | Data science at VITO’s health department | Jef Hooyberghs (Flemish Institute for Technological Research) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 03.06.2015 | The role of Insulators in tissue-specific gene repression | Paweł Bednarz (MIM UW) | |
| 27.05.2015 | The model of metastasis formation and its utility in the clinic | Ewa Szczurek (MIM UW) | |
| 20.05.2015 | Efficient isotopic fine structure generator | Mateusz Łącki (MIM UW) Michał Startek (MIM UW) | |
| 13.05.2015 | Powierzchnie minimalne w badaniu struktury topologicznej białek | Wanda Niemyska (UŚ i Wydział Chemii UW) | |
| 06.05.2015 | Playing with RRBS data (Reduced representation bisulfite sequencing), unbalanced designs and R package "methylKit" | Przemysław Biecek (ICM UW) | |
| 29.04.2015 | Tadpoles: new entangled motifs in proteins | Joanna Sułkowska (Faculty of Chemistry, UW) | |
| 22.04.2015 | Information flow in signal transduction pathways | Michał Komorowski (IPPT PAN) | |
| 15.04.2015 | Seminar cancelled due to the RECOMB 2015 conference | ||
| 08.04.2015 | DNA mechanics in mammalian genomes | Damian Wójtowicz (NCBI, NLM, NIH) | |
| 01.04.2015 | Data analysis and modeling in human genomics | Maciej Sykulski (Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge, University Paris-Est) | |
| 25.03.2015 | Tissue-specific metabolic modeling | Weronika Wronowska (MIM UW and Faculty of Biology, UW) | |
| 18.03.2015 | Influence of FTO and IRX3 genes on predisposition to obesity | Ilona Grabowicz (MIM UW) | |
| 11.03.2015 | Modelling the evolution of mobile genetic elements | Michał Startek (MIM UW) | |
| 04.03.2015 | Tree reconciliation: theory and applications | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 25.02.2015 | Hubness-aware data mining and its biomedical applications | Krisztian Buza (Semmelweis University, Budapest, Hungary) | |
| 21.01.2015 | Integrative computational model for tissue specific gene regulation | Paweł Bednarz (MIM UW) | |
| 14.01.2015 | K-nearest neighbors estimator for mutual information used as sensitivity measure | Agata Charzyńska (IPI PAN and MIM UW) | |
| 07.01.2015 | Machine learning approaches to predict mammalian enhancers | Julia Herman-Iżycka (MIM UW) | |
| 17.12.2014 | Review of phylogenetic networks | Agnieszka Mykowiecka (MIM UW) | |
| 10.12.2014 | A few comments on the proliferation of transposable elements in sexual populations | Krzysztof Gogolewski (MIM UW) | |
| 03.12.2014 | Cellular resources management: the case of mitochondria | Agnieszka Chacińska (Int. Inst. of Molecular and Cell Biology) | |
| 26.11.2014 | Co-expression analysis of Hi-C topological domains | Rafał Zaborowski (MIM UW) | |
| 19.11.2014 | Sphingolipids in cancer development - studies using "The Cancer Genom Atlas" | Weronika Wronowska (MIM UW and Faculty of Biology UW) | |
| 12.11.2014 | Network of Organic Chemistry (literature review). | Piotr Dittwald (MIM UW and IChO PAN) | |
| 05.11.2014 | A few comments on Multiple Gene Duplication Problems | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 29.10.2014 | Modelling Fine Structure of Mass Spec Results (Presentation) | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 22.10.2014 | Computational aspects of the presence of drug resistance mechanisms | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 15.10.2014 | Stochastic regulatory networks in space | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 08.10.2014 | , MOCCA: accurate identification of transcription factor footprints by modeling DNase I cut profiles | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 01.10.2014 | Organisation of the work |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 04.06.2014 | Detection of drug resistance-associated mutations in bacteria | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 28.05.2014 | Molecular networks in a systems approach to disease | Janusz Dutkowski (Data4Cure/UCSD) | Molecular networks in a systems approach to disease. | Aleksander Jankowski (MIM UW) |
| 14.05.2014 | Seemingly similar - heterogeneity of bladder cancer | Weronika Wronowska (MIM UW) | |
| 07.05.2014 | Treatment discovery: human malaria and vector-borne diseases endemic in the tropics | Victor Osamor (MIM UW) | |
| 30.04.2014 | Assisted genome assembly for the analysis of ChipSeq data | Krisztián Buza (MIM UW) | |
| 23.04.2014 | Comprehensive analysis of knotted proteins from folding to function | Joanna Sułkowska (CENT & Faculty of Chemistry UW) | |
| 16.04.2014 | Gene Expression Classification of Bladder Cancer into Molecular Subtypes | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 09.04.2014 | On the existence and stability of equilibrium probability measures in Gaussian mutator models with environmental stress within Fisher's geometric framework | Michał Startek (MIM UW) | |
| 02.04.2014 | Further Inquiries Into Electron Transfer Dissociation with MassTodon Slides | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 26.03.2014 | Diameters of Reconciliation | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 19.03.2014 | D2N: Prediction of Distance-to-Native of protein structure using Physicochemical properties and Machine Learning Models | Prashant Singh Rana (Indian Institute of Technology, Delhi) | |
| 12.03.2014 | The influence of noise characteristics on the relative stability of attractors in bistable biochemical systems | Joanna Jaruszewicz (IPPT PAN) | |
| 05.03.2014 | Multi-parameter sensitivity analysis based on the information theoretical measure | Agata Charzyńska (IPI PAN) | |
| 26.02.2014 | The systemic regulation of eukaryotic genes based on spatial chromatin organization | Jacek Patryn (MISDoMP) | |
| 19.02.2014 | Nucleotide-resolution DNA double-strand breaks mapping by next-generation sequencing | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 22.01.2014 | A few comments on Sibelia: a tool for finding synteny blocks in multiple closely related microbial genomes using iterative de Bruijn graphs | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 15.01.2014 | About NIPS conference | Krisztian Buza (MIM UW) | |
| 08.01.2014 | Analysis of Non-allelic homologous recombination mediated by LINEs | Michał Startek (MIM UW) | |
| 18.12.2013 | Enigmatic nature of sphingolipids | Weronika Wronowska (MIM UW) | |
| 11.12.2013 | A few comments on isotopic distribution: aggregated and fine structure approaches; application in lipid/peptide classification | Piotr Dittwald (MIM UW) | |
| 04.12.2013 | Mass spectrometry analysis of proteins using Electron Transfer Dissociation: statistical model Slides | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 27.11.2013 | MIND: a soft-sensor to improve mass accuracy in high-resolution top-down proteomics | Dirk Valkenborg (Hasselt University/VITO, Belgium) | Mass spectrometry analysis of proteins using Electron Transfer Dissociation | Frederik Lermyte (Antwerp University, Belgium) |
| 20.11.2013 | Spatial, stochastic, rule-based modeling of cellular signaling pathways | Marek Kochanczyk (IPPT PAN) | |
| 13.11.2013 | Tracing evolution of gene families | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 06.11.2013 | Transcription factor dimers: prediction and structural insights | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 30.10.2013 | Recent literature review | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 23.10.2013 | Diameters of reconciliation costs functions | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 16.10.2013 | Signaling pathway modeling and model analysis on the example of the ceramides metabolism | Agata Charzyńska (MIM UW & IPI PAN) | |
| 09.10.2013 | eCAMBer: efficient support for large-scale comparative analysis of multiple bacterial strains | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 02.10.2013 | Organisation of the work |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 5.06.2013 | Modelling the evolution of transposable elements | Arnaud le Rouzic (CNRS, Gif-sur-Yvette) | |
| 22.05.2013 | Modeling sphingolipid metabolism | Agata Charzynska (IPI PAN) Weronika Wronowska (Wydział Biologii UW) | BioHealth Computing Program | Philippe Sabatier (Université Joseph Fourier Grenoble) |
| 22.05.2013 | Analysis of variance, data visualisation and multiple hypothesis testing in the identification of splicing events in Arabidopsis | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 15.05.2013 | The problem of disovering differential regulatory elements between cell types | Paweł Bednarz (MIM UW) | |
| 8.05.2013 | Assisted Genome Assembly: An introduction and initial results | Krisztian Buza (MIM UW) | |
| 24.04.2013 | Parallel tempering algorithm - theory and applications | Mateusz Łącki (MIM UW) | |
| 17.04.2013 | Interesting papers from RECOMB 2013, a subjective review | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 10.04.2013 | Chromatin remodeling, a key process in regulation of global genome expression | Jacek Patryn (IBB PAN, Warszawa) | |
| 3.04.2013 | SimRNA: program for RNA folding simulations | Michał Boniecki (IIMCB, Warszawa) | |
| 27.03.2013 | Metaheuristic Algorithm Applications for the NMR Protein Structure-Based Assignment Problem | Murodzhon Akhmedov (Sabanci University, Istanbul) | |
| 20.03.2013 | Maximizing Deep Coalescence Cost | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 13.03.2013 | Maximum entropy models of biological data | Thierry Mora (Laboratoire de Physique Statistique, Ecole Normale Supérieure) | |
| 6.03.2013 | Quantifying immune receptor diversity | Aleksandra Walczak (Laboratoire de Physique Théorique, Ecole Normale Supérieure) | |
| 27.02.2013 | Comparative analysis of regulatory networks in plants | Torgeir Hvidsten (Norwegian University of Life Sciences) | |
| 20.02.2013 | A Markov-chain-based regression model for the analysis of high-resolution enzymatically 18O-labeled mass spectra | Dirk Valkenborg (Flemish Institute of Technology vito.be) | |
| 23.01.2013 | How cells do statistics? Inference, signal transduction and experimental design | Michał Komorowski (IPPT PAN) | |
| 16.01.2013 | Estimation of telomere lengths from whole-genome-sequencing data | Szymon Kiełbasa (Bioinformatics Center of Expertise, Leiden University Medical Center) | |
| 9.01.2013 | Bioinformatyczne narzędzia wykrywania transpozonów | Michał Startek (MIM UW) | |
| 19.12.2012 | Variance decomposition in biomolecular models of signaling pathways | Agata Charzyńska (IPI PAN) | |
| 12.12.2012 | Przewidywanie funkcjonalnych elementów DNA na podstawie danych Chip-Seq | Joanna Giemza i Paweł Bednarz (MIM UW) | |
| 5.12.2012 | Uliniowienie wielu sekwencji przez klastrowanie residuów | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 28.11.2012 | Porównanie bibliotek: Jaspar, Transfac i Genomatics, w oparciu o dane chip-seq dla 44 czynników transkrypcyjnych" | Michał Dąbrowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN im. Nenckiego) | |
| 21.11.2012 | Signal extraction and statistical modelling of peptide-centric mass spectrometry data | Tomasz Burzykowski (Center for Statistics, Hasselt University) | |
| 14.11.2012 | Cukrzyca ciężarnych - możliwości zastosowania metod uczenia maszynowego w prognostyce | Grzegorz Napiórkowski (II Katedra i Klinika Położnictwa i Ginekologii WUM) | |
| 7.11.2012 | Rola nukleaz w metabolizmie RNA u eukariota | Andrzej Dziembowski (IBB PAN) | |
| 30.10.2012 | Metryki dla drzew filogenetycznych oparte na skojarzeniach w grafie podziałów drzewa | Jarosław Paszek (MIM UW) | |
| 24.10.2012 | Za dużo, za mało, w sam raz... Analiza architektury genomu człowieka pod względem potencjalnych miejsc powstawania nawracających delecji i duplikacji | Piotr Dittwald (MIM UW) | |
| 17.10.2012 | Modelowanie jednorodnych układów reakcji biochemicznych: przykłady i technologie | Mikołaj Rybiński (MIM UW i IMDiK) | |
| 10.10.2012 | Stochastyczne modele ekspresji genów - co możemy wymodelować i pomierzyć eksperymentalnie? | Jan Poleszczuk (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 06.06.2012 | Modelowanie skuteczności leczenia opartego na hipertermii | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 30.05.2012 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 16.05.2012 | Widespread cooperative binding of mammalian transcription factor complexes in vivo | Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) | |
| 09.05.2012 | Kombinatoryczne stosowanie leków: przegląd literatury i baz danych | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 25.04.2012 | O transpozonach raz jeszcze | Michał Startek (MIM UW) | |
| 18.04.2012 | O uzgadnianiu drzew raz jeszcze | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 04.04.2012 | Mocne i słabe strony metod rekonstrukcji sieci zależności genowych | Robert Szczelina (Instytut Informatyki UJ) | |
| 28.03.2012 | Histon łącznikowy H1 u Arabidopsis thaliana | Magdalena Kroteń (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) | |
| 21.03.2012 | Evolution of drug resistance and compensatory mutations: literature review | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 14.03.2012 | Inverted low-copy repeats and genome instability – a genome-wide approach | Piotr Dittwald (MIM UW) | |
| 07.03.2012 | Nowe techniki badania dostępności chromatyny: przegląd literatury | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 29.02.2012 | Jak reprezentować stan chromatyny w komputerze: przegląd literatury | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 22.02.2012 | Ogólne podejście do uzgadniania drzew genów z drzewami gatunków | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 15.02.2012 | Przedstawienie pracy „Detecting Novel Associations in Large Data Sets”, David N. Reshef et al., Science (2011) | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 18.01.2012 | Efektywne mapowanie odczytów z sekwencera zawierających błędy | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 11.01.2012 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 04.01.2012 | Modelowanie danych spektrometrycznych (algorytm do liczenia obwiedni izotopowych) | Piotr Dittwald (MIM UW) | |
| 21.12.2011 | Analiza globalnych zmian transkryptomu komórek T87 Arabidopsis thaliana w odpowiedzi na stres abiotyczny | Marta Prymakowska-Bosak (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) | |
| 14.12.2011 | Statistics for dynamical models of biochemical systems | Michał Komorowski (Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN) | |
| 07.12.2011 | Predykcja oporności na antybiotyki w bakteriach na podstawie sekwencji genomowych | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 30.11.2011 | Nowe algorytmy dla uzgadniania nieukorzenionych drzew genów i ukorzenionych drzew gatunków | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 23.11.2011 | Baza danych TRAM – łatwy dostęp i integracja danych użytkownika z Ensembl funcgen | Michał Dąbrowski (Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN) | |
| 16.11.2011 | Toward bridging the gap between genotype and phenotype – systems biology approach | Teresa Przytycka (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, Maryland, USA) | |
| 09.11.2011 | Chwytanie obszarów regulatorowych na gorącym uczynku w sieci Bayesowskie | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 02.11.2011 | CAMBer: an approach to support comparative analysis of multiple bacterial strains | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 26.10.2011 | Predicting cell type-specific transcription factor cooperative binding | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 19.10.2011 | Odtwarzanie interakcji chromatyny na podstawie danych o modyfikacjach histonów | Łukasz Bieniasz-Krzywiec (MIM UW) | |
| 12.10.2011 | Komórkowo-swoisty mechanizm apoptozy indukowanej przez stres | Wiesława Widłak (Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów, Instytut Onkologii, Oddział w Gliwicach) | |
| 05.10.2011 | Modeling genetic interactions in cancer | Ewa Szczurek (Max Planck Institute for Molecular Genetics) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 01.06.2011 | Simulating stochastic cell populations | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 25.05.2011 | Finding transcription factors involved in development by motif enrichment in enhancers targeted by feed-forward regulation | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 18.05.2011 | Alignment of protein structures | Paweł Daniluk (Wydział Fizyki UW oraz Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN) | |
| 11.05.2011 | Genomic hypomethylation in the human germline associates with structural mutability in the human genome | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 04.05.2011 | Physicochemical features of aminoglycoside modifying enzymes oraz Yet another clustering method for molecular dynamics simulations' data | Julia Romanowska (ICM UW) | |
| 20.04.2011 | Selected papers from RECOMB 2011 | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 13.04.2011 | Text indexes and sequencing read mapping | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 06.04.2011 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 30.03.2011 | Finding transcription factors involved in development by motif enrichment in enhancers targeted by feed-forward regulation | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 23.03.2011 | The determinants of nucleosome organisation | Aleksander Jankowski (MIM UW oraz Genome Institute of Singapore) | |
| 16.03.2011 | Optimal signal detection and signal estimation from next-gen sequence tag profiles | Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) | |
| 09.03.2011 | Rhythmic diel pattern of gene expression in maize – nocturnal life of plants | Paweł Sowiński (Wydział Biologii UW) | |
| 02.03.2011 | Design of experiments and genomic data analysis in array-based CGH technology | Tomasz Gambin (Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych, Politechnika Warszawska) | |
| 23.02.2011 | Selected papers from the computational statistics conference Neural Information Processing Systems (NIPS) | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 16.02.2011 | Semantic Internet for bioinformatics – state of the art and perspectives | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 19.01.2011 | Sequencing: from first to third generation. An overview | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 12.01.2011 | Comparative analysis of aminoglycosidic antibiotics' binding sites | Julia Romanowska (Wydział Fizyki UW oraz ICM UW) | |
| 05.01.2011 | Global methods of chromatine mapping in the studies of functional organization of genomes | Andrzej Jerzmanowski (Wydział Biologii UW oraz IBB PAN) | |
| 15.12.2010 | Model-based testing for heterogenity of the cell membrane receptors | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 08.12.2010 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 01.12.2010 | Odkrywanie kombinatorycznych kompleksów białkowych | Janusz Dutkowski (Departments of Medicine and Bioengineering, University of California, San Diego) | |
| 24.11.2010 | Analiza statystyczna układu nerwowego Caenorhabditis elegans | Piotr Dittwald (MIM UW) | |
| 17.11.2010 | Dynamika amplifikacji transpozonów roślinnych | Michał Startek (MIM UW) | |
| 10.11.2010 | Programming scientific data pipelines with the Taverna workflow management system | Paolo Missier (School of Computer Science, University of Manchester) | |
| 03.11.2010 | Bi-billboard: symetryzacja i odpowiedni wybór gatunku referencyjnego poprawiają predykcje elementów regulatorowych | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 27.10.2010 | Korekcja błędów w modelu drzew uzgadniających | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 20.10.2010 | Uzgadnianie anotacji genomów blisko spokrewnionych szczepów bakterii | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 13.10.2010 | Usługi sieciowe Taverny do analizy modeli systemów biologicznych | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 06.10.2010 | Przegląd referatów z konferencji useR2010 | Przemysław Biecek (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 02.06.2010 | Semi-supervised learning: teoria, oprogramowanie i przykłady zastosowania do danych biologicznych na podstawie pracy Szczurek et al. 2010 | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 26.05.2010 | Flipping the switch on stress tolerance ABI1 PP2C functional association network | Agnieszka Ludwikow (Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii, Uniwersytet Adama Mickiewicza, Poznań) | |
| 19.05.2010 | Modelowanie ewolucji transpozonów roślinnych | Michał Startek (MIM UW) | |
| 12.05.2010 | Biophysical modeling of ChIP-seq data reveals complexity of protein-DNA binding in vivo | Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) | |
| 05.05.2010 | Przewidywanie miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w obecności nukleosomów | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 28.04.2010 | Model proteolizy uwzględniający czas | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 21.04.2010 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 14.04.2010 | Odkrywanie deregulacji genów poprzez eksperymenty perturbacyjne | Ewa Szczurek (Max Planck Institute for Molecular Genetics oraz MIM UW) | |
| 31.03.2010 | Porównanie ośmiu szczepów M. tuberculosis w obecności danych o oporności na leki | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 24.03.2010 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 17.03.2010 | Gromadzenie, analiza i wnioskowanie z danych aCGH - mikromacierze DNA | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 10.03.2010 | Jakościowa predykcja ekspresji genów w modelu probabilistycznym | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 03.03.2010 | Kompleksy przebudowujące chromatynę u roślin – stan wiedzy na dziś i perspektywy badań | Andrzej Jerzmanowski (Wydział Biologii UW oraz IBB PAN) | |
| 24.02.2010 | Modelowanie procesu proteolizy | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 17.02.2010 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 20.01.2010 | Analiza danych genomicznych oparta na teorii informacji | Magdalena Rowicka (Sealy Center for Molecular Medicine, University of Texas Medical Branch at Galveston) | |
| 13.01.2010 | Topology of PPI Networks – Applications and Questions | Limsoon Wong (National University of Singapore) | |
| 06.01.2010 | Maksymalizacja wiarygodności w modelu drzew uzgadniających | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 16.12.2009 | Analiza porównawcza globalnych wzorów wiązania czynnika transkrypcyjnego HSF1 i profili ekspresji genów swoistych dla hepatocytów i spermatocytów | Wiesława Widłak (Instytut Onkologii, Gliwice) | |
| 09.12.2009 | Dane molekularne dla M. tuberculosis i możliwości ich wykorzystania do walki z opornością na leki | Michał Woźniak (MIM UW) | |
| 02.12.2009 | Od danych chip-seq do profilu wiązania czynnika transkrypcyjnego - kontynuacja | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 25.11.2009 | Od danych chip-seq do profilu wiązania czynnika transkrypcyjnego | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 18.11.2009 | Niejednorodność receptorów na membranie komórkowej | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 04.11.2009 | Analiza drzew o poetykietowanych liściach w kontekście problemu konkurujących hipotez ewolucyjnych | Jakub Koperwas (Instytut Informatyki, Politechnika Warszawska) | |
| 28.10.2009 | Modelowanie procesu amplifikacji retrotranspozonów rodziny Alu | Michał Startek (MIM UW) | |
| 21.10.2009 | Omówienie prac z konferencji RECOMB Comparative Genomics 2009 | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 14.10.2009 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 07.10.2009 | Badania nad powstawaniem oporności M. tuberculosis na leki | Michał Woźniak (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 03.06.2009 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 27.05.2009 | Algebraiczne metody budowania cech obiektów - zastosowania w problemie klasyfikacji (na podstawie prac Risi Kondora) | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 20.05.2009 | Predicting transcription factor binding to the human genome in the era of high-throughput sequencing | Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) | |
| 13.05.2009 | Kryterium wyboru modelu w wybranym problemie regresji na przykładzie analizy danych biologicznych i medycznych | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 06.05.2009 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 29.04.2009 | Przewidywanie położeń nukleosomów na nici DNA | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 22.04.2009 | Metoda EM w zastosowaniu do klasyfikacji interakcji w sieciach oddziaływań białko-białko | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 08.04.2009 | Analiza danych pochodzących z sekwencjonerów nowej generacji | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 01.04.2009 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 25.03.2009 | Bifurkacje w systemach dynamicznych: omówienie podstawowych typów, przykłady zastosowań w biologii systemów | Andrzej Mizera (Abo Akademi University & Turku Centre for Computer Science, Turku, Finlandia oraz IPPT PAN) | |
| 18.03.2009 | Discovering and modelling recurrent and non-recurrent rearrangements in human genome | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 11.03.2009 | Czy neuroinformatyka to coś dla informatyka? | Daniel Wójcik (Instytut Biologii Doświadczalnej im. Neckiego, PAN) | |
| 04.03.2009 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 18.02.2009 | Algorytmy agregacji rankingów | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 14.01.2009 | Ziarna podzbiorowe w algorytmie BLAST - zastosowanie i optymalizacja | Michał Startek (MIM UW) | |
| 07.01.2009 | Odkrywanie koewoluujących pozycji w białkach | Damian Wójtowicz (MIM UW oraz NCBI, NLM, NIH, Bethesda, MD, USA) | |
| 17.12.2008 | Dyskretne i niedyskretne modele sieci neuronów | Winfried Just (Dept. of Math., Ohio University, Athens, USA) | |
| 10.12.2008 | Niezmienniki filogenetyczne (na podstawie rozdziału z książki Reconstructing Evolution) | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 03.12.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 26.11.2008 | Analiza wrażliwości układów reakcji biochemicznych (kontynuacja) | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 19.11.2008 | Analiza wrażliwości układów reakcji biochemicznych | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 12.11.2008 | Modelowanie motywów przy użyciu cech charakterystycznych | Aleksander Jankowski (MIM UW) | |
| 5.11.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 29.10.2008 | Estymacja FDR (false discovery rate) oraz inne zagadnienia przy analizie danych aCGH (array comparative genomic hybridization) | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 22.10.2008 | Monitorowanie stanu przeszczepionej nerki i problemy statystyczne związane z tym zagadnieniem | Przemysław Biecek (MIM UW) | |
| 15.10.2008 | Modelowanie odpowiedzi białkowej na szok termiczny w komórce eukariotycznej | Andrzej Mizera (Abo Akademi University & Turku Centre for Computer Science, Turku, Finlandia oraz IPPT PAN) | |
| 08.10.2008 | Omówienie prac z konferencji ECCB 2008 | Norbert Dojer (MIM UW) Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 01.10.2008 | Talk and crosstalk properties emerging from cause-effect experimental data | Ewa Szczurek (MaxPlank Institute, Berlin oraz MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 4.06.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 28.05.2008 | Ziarna białkowe: alfabety i zastosowanie w algorytmie BLAST | Maciej Sykulski (MIM UW) | |
| 21.05.2008 | Sieci filogenetyczne: modelowanie i rekonstruowalność | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 14.05.2008 | Selekcja modeli aktywacji receptora szlaku sygnałowego JAK-STAT | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 7.05.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 23.04.2008 | Analiza sekwencji DNA w pobliżu miejsca terminacji translacji w różnych prokaryotach | Przemysław Biecek (MIM UW oraz Uniwersytet Wrocławski) | |
| 16.04.2008 | Algorytm Pearl'a dla sieci Bayesowskich | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 9.04.2008 | Sieci Bayesowskie - wprowadzenie | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 2.04.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 19.03.2008 | O dokładnej rekonstrukcji drzew genów z całych genomów | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 12.03.2008 | Przegląd metod obliczeniowych do przewidywania oddziaływań domena-domena | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 5.03.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 27.02.2008 | Przewidywanie interakcji białko-białko i domena-domena - podejście obliczeniowe (przegląd) | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 20.02.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 23.01.2008 | Markowowski model aktywności egzopeptydaz - kontynuacja | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 16.01.2008 | Markowowski model aktywności egzopeptydaz | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 9.01.2008 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 19.12.2007 | Rozkład spektralny macierzy kwadratów odległości z zastosowaniami w biologii strukturalnej - kontynuacja | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 12.12.2007 | Zastosowania statystyki i informatyki w genomice i badaniach dynamiki populacji | Przemysław Biecek (MIM UW i IM PAN oddzial we Wrocławiu) | |
| 5.12.2007 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 28.11.2007 | Struktura przestrzeni drzew z relacją sąsiedztwa NNI | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 21.11.2007 | Rozkład spektralny macierzy kwadratów odległości z zastosowaniami w biologii strukturalnej | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 14.11.2007 | Projektowanie eksperymentów perturbacyjnych w sieciach sygnalizacyjnych i znajdowanie modułów regulacji genów | Ewa Szczurek (MIM UW oraz Max Planck Institute Berlin) | |
| 7.11.2007 | Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 24.10.2007 | Przewidywanie interakcji białko-białko - podejście ewolucyjne (c.d.) | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 17.10.2007 | Przewidywanie interakcji białko-białko - podejście ewolucyjne | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 10.10.2007 | Identyfikacja transpozonów typu PIF/Harbinger w genomie Medicago Trancatula | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 3.10.2007 | Omówienie pewnych prac z konferencji ECCB/ISMB, Wiedeń, 2007 | Jerzy Tiuryn (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 6.06.2007 | Analiza danych mikromacierzowych, część 2 | Przemysław Świtalski (MIM UW) Krzysztof Zalewski (MIM UW) | |
| 30.05.2007 | Analiza danych mikromacierzowych, część 1 | Jakub Mieczkowski (MIM UW) Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 23.05.2007 | Omówienie najciekawszych prac z konferencji RECOMB 2007 | Bartek Wilczyński (IM PAN oraz MIM UW) | |
| 16.05.2007 | Przeszukiwanie przestrzeni drzew filogenetycznych - kontynuacja | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 9.05.2007 | Przeszukiwanie przestrzeni drzew filogenetycznych | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 25.04.2007 | Identyfikacja architektury genomu odpowiedzialnej za powstawanie chorób genomowych | Paweł Stankiewicz (Zakład Genetyki Medycznej, Instytut Matki i Dziecka) | |
| 18.04.2007 | Przegląd pewnych nowych wyników w bioinformatyce | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 4.04.2007 | Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 14.03.2007 | Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 7.03.2007 | Metody identyfikacji obszarow cis-regulatorowych | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 28.02.2007 | Modelowanie sieci sygnalizacyjnych w rachunku pi | Ewa Szczurek (Max Planck Institute Berlin oraz MIM UW) | |
| 21.02.2007 | CTX-BLAST - kontekstowa wersja algorytmu BLAST | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 24.01.2007 | Modelowanie i weryfikacja komórkowych szlaków sygnałowych (dokończenie) | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 17.01.2007 | Modelowanie i weryfikacja komórkowych szlaków sygnałowych | Mikołaj Rybiński (MIM UW) | |
| 10.01.2007 | Odtwarzanie stochastycznych sieci logicznych z danych mikromacierzowych | Bartek Wilczyński (IM PAN i MIM UW) | |
| 20.12.2006 | EM dla bayesowskiego modelu hierarchicznego Szymona Nowakowskiego. - kontynuacja | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 13.12.2006 | EM dla bayesowskiego modelu hierarchicznego Szymona Nowakowskiego | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 6.12.2006 | Hierarchiczne klastrowanie stanów łańcucha Markowa | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 29.11.2006 | Odtwarzanie sieci interakcji białko-białko u wspólnego przodka gatunków | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 22.11.2006 | Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja) | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 15.11.2006 | Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja) | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 8.11.2006 | Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko. (kontynuacja) | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 1.11.2006 | Dzień wolny | ||
| 25.10.2006 | Uliniowienie (alignment) sieci oddziaływań białko-białko | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 11.10.2006 | Analiza ewolucji genomów. (kontynuacja) | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 4.10.2006 | Analiza ewolucji genomów | Damian Wójtowicz (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 07.06.2006 | Uniform generation of random directed graphs with prescribed degree sequence | Petko Fiziev (Max Plank Institute for Molecular Genetics, Berlin) | |
| 31.05.2006 | Lokalne klasyfikatory jako narzędzie analizy i klasyfikacji sygnałów | Wit Jakuczun (Wydział MiNI, Politechnika Warszawska) | |
| 24.05.2006 | Grafy przecięć - dwa zastosowania w Biologii Obliczeniowej | Teresa Przytycka (National Center of Biotechnology Information, NLM, NIH, Bethesda, MD, USA) | |
| 17.05.2006 | O pewnej patologii związanej z bezskalowymi grafami losowymi Barabasiego-Albert-Bollobasa | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 10.05.2006 | Klastrowanie spektralne łańcuchów Markowa | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 26.04.2006 | O geometrycznych modelach drzew filogenetycznych | Jarosław Wiśniewski (MIM UW) | |
| 12.04.2006 | Omówienie konferencji RECOMB 2006 | Janusz Dutkowski (MiM UW) Ewa Mąkosa (IMPAN) Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 05.04.2006 | PQ drzewa | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 29.03.2006 | Efektywne znajdowanie optymalnych sieci Bayesowskich - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 22.03.2006 | Efektywne znajdowanie optymalnych sieci Bayesowskich | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 08.03.2006 | Bezskalowe grafy losowe - kontynuacja | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 01.03.2006 | O Drożdżach i ślimakach | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 22.02.2006 | Bezskalowe grafy losowe | Janusz Dutkowski (MIM UW) | |
| 25.01.2006 | Odtwarzanie sieci regulacji genów na podstawie danych o ekspresji | Bartek Wilczyński (IM PAN) | |
| 18.01.2006 | Przegląd prac z konferencji: European Conference on Computational Biology | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 11.01.2006 | Wykorzystanie bazy lokalnych deskryptorów do rekonstrukcji struktury i sekwencji białek | Michał Drabikowski (MIM UW) | |
| 21.12.2005 | Algorytm k-means a klasyfikacja bayesowska | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 14.12.2005 | Porównywanie klastrowań - kontynuacja oraz dyskusja nad metodami weryfikacji | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 07.12.2005 | Porównywanie klastrowań | Bogusław Kluge (MIM UW) | |
| 30.11.2005 | Poszukiwanie statystycznego potencjału opisującego oddziaływanie między ligandem a centrum aktywnym białka | Marcin von Grotthuss (BioInfoBank Institute) | |
| 23.11.2005 | Przewidywanie enzymatycznej funkcji na podstawie trójwymiarowego kształtu białka | Marcin von Grotthuss (BioInfoBank Institute) | |
| 16.11.2005 | Wpływ działania estrogenu na ekspresję genów w wątrobie na podstawie danych mikromacierzowych | Ewa Mąkosa (MIM UW) | |
| 09.11.2005 | Metoda lokalnych deskryptorów w przewidywaniu funkcji białek | Marta Łuksza (MIM UW) | |
| 19.10.2005 | Przegląd prac z III warsztatów genomiki porównawczej RECOMB Comparative Genomics 2005 | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 12.10.2005 | Rozpoznawanie miejsc wiążących czynniki transkrypcyjne | Szymon Nowakowski (MIM UW) | |
| 05.10.2005 | Spotkanie organizacyjne |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 18.05.2005 | Paralogi, ortologi i genomika porównawcza - kontynuacja | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 11.05.2005 | Paralogi, ortologi i genomika porównawcza | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 27.04.2005 | Odkrywanie koregulacji genów na podstawie lokalnych podobieństw ekspresji | Bartek Wilczyński (IM PAN i MIM UW) | |
| 20.04.2005 | Dynamiczne sieci bayesowskie w modelowaniu regulacji genów. - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 13.04.2005 | Dynamiczne sieci bayesowskie w modelowaniu regulacji genów. - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 6.04.2005 | Dynamiczne sieci bayesowskie w modelowaniu regulacji genów. - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 23.03.2005 | Dynamiczne sieci bayesowskie w modelowaniu regulacji genów. - kontynuacja | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 16.03.2005 | Dynamiczne sieci bayesowskie w modelowaniu regulacji genów | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 09.03.2005 | Miary oceny jakości testowania wielu hipotez statystycznych w zastosowaniach do mikromacierzy DNA. - kontynuacja | Konrand Furmańczyk (SGGW) | |
| 02.03.2005 | Miary oceny jakości testowania wielu hipotez statystycznych w zastosowaniach do mikromacierzy DNA | Konrand Furmańczyk (SGGW) | |
| 23.02.2005 | Klasyfikacja próbek w spektrometrii masowej. (kontynuacja) | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 19.01.2005 | Idealne formy oddziaływań między aminokwasami w białkach. streszczenie | Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 12.01.2005 | Klasyfikacja próbek w spektrometrii masowej | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 5.01.2005 | Dr. Frankenstein - fully automated structure prediction by assembly of fold-recognition models' fragments | Michał J. Gajda (IIMCB oraz Wydział MiNI PW) | |
| 15.12.2004 | Minimalny model zwijania białek - motyw alfa | Karol Droste (MIM UW) | |
| 8.12.2004 | Poprawnie sformułowane przepływy czynności w bioinformatyce | Jacek Sroka (MIM UW) | |
| 1.12.2004 | Sieci Bayesowskie a sieci regulacyjne genów | Norbert Dojer (MIM UW) | |
| 24.11.2004 | Baza danych szlaków metabolicznych i substancji mogących w nich uczestniczyć | Jakub Jurkiewicz (MIM UW i ICM UW) | |
| 17.11.2004 | Markowowski model ewolucji genomu | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 10.11.2004 | Macierz substytucji aminokwasów uwzględniająca informację strukturalną | Szymon Nowakowski (MIM UW) | |
| 03.11.2004 | Metoda lokalnych deskryptorów - wybrane wyniki | Michał Drabikowski (MIM UW) | |
| 27.10.2004 | O strukturze uzgodnień | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 20.10.2004 | Klasyfikcja danych spektrometrycznych - metryki na rozkładach | Joanna Reda (Wydział MiNI PW oraz MIM UW) | |
| 13.10.2004 | Uogólnione sieci logiczne jako model regulacji genów | Bartek Wilczyński (IMPAN) | |
| 06.10.2004 | Spotkanie organizacyjne |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 26.05.04 | Matematyczna analiza prostego modelu ewolucji genomu | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 19.05.04 | Sieci bayesowskie z czasem ciągłym | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 12.05.04 | Zarządzanie danymi w biologii obliczeniowej | Jacek Sroka (MIM UW) | |
| 05.05.04 | Wyprowadzanie topologii sieci regulacyjnych | Bartek Wilczyński (IM PAN) | |
| 21.04.04 | O minimalizacji drzew uzgadniających | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 31.03.04 | Analiza złożoności problemu znajdowania przypisań w metodzie lokalnych deskryptorów - kontynuacja | Michał Drabikowski (MIM UW) | |
| 24.03.04 | Analiza złożoności problemu znajdowania przypisań w metodzie lokalnych deskryptorów | Michał Drabikowski (MIM UW) | |
| 17.03.04 | Analiza składowych głównych jako metoda redukcji wymiaru w zagadnieniu klasyfikacji | Anna Gambin (MIM UW) | |
| 10.03.04 | Wprowadzenie do SVM (Support Vector Machines) - kontynuacja | Joanna Reda (Wydział MiNI PW oraz MIM UW) | |
| 03.03.04 | Wprowadzenie do SVM (Support Vector Machines) - kontynuacja | Joanna Reda (Wydział MiNI PW oraz MIM UW) | |
| 25.02.04 | Wprowadzenie do SVM (Support Vector Machines) | Joanna Reda (Wydział MiNI PW oraz MIM UW) | |
| 18.02.04 | Metody przewidywania funkcji białka na podstawie jego struktury - kontynuacja | Karol Droste (MIM UW i BioInfoBank) | |
| 11.02.04 | Metody przewidywania funkcji białka na podstawie jego struktury | Karol Droste (MIM UW i BioInfoBank) | |
| 14.01.04 | Znajdowanie modeli optymalnych dla małych sieci genów | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 07.01.04 | Model Ewolucji Genomu - Lancuch Markowa | Damian Wójtowicz (MIM UW) | |
| 17.12.03 | Zastosowanie metody Expectation Maximization do odkrywania związków regulacyjnych pomiędzy genami | Bartek Wilczyński (MIM UW) | |
| 10.12.03 | Probabilistyczne modele kinetyki ekspresji genów - kontynuacja | Jacek Miękisz (MIM UW) Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 03.12.03 | Probabilistyczne modele kinetyki ekspresji genów | Jacek Miękisz (MIM UW) Piotr Pokarowski (MIM UW) | |
| 26.11.03 | Probabilistyczne modele kinetyki ekspresji genów | Anna Gambin (MIM UW) Andrzej Kierzek (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN, Warszawa) | |
| 19.11.03 | O teoretycznym i praktycznym podejściu do uzgadniania drzew filogenetycznych z horyzontalnym transferem genów | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 12.11.03 | O teoretycznym i praktycznym podejściu do uzgadniania drzew filogenetycznych z horyzontalnym transferem genów | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 05.11.03 | O teoretycznym i praktycznym podejściu do uzgadniania drzew filogenetycznych z horyzontalnym transferem genów | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 29.10.03 | O teoretycznym i praktycznym podejściu do uzgadniania drzew filogenetycznych z horyzontalnym transferem genów | Paweł Górecki (MIM UW) | |
| 22.10.03 | Estymatory rozkładów prawdopodobieństwa występowania sekwencji aminokwasowej w uliniowieniu (kontynuacja) | Szymon Nowakowski (MIM UW) | |
| 15.10.03 | Estymatory rozkładów prawdopodobieństwa występowania sekwencji aminokwasowej w uliniowieniu | Szymon Nowakowski (MIM UW) |
| Date | Title | Speaker | Videos |
|---|---|---|---|
| 27.05.03 | Alternatywna metoda klasteryzacji deskryptorów i zastosowanie do porównywania struktury białek | Paweł Daniluk (MIM UW) | |
| 20.05.03 | Genetyka agresji | Piotr Stępień (Wydział Biologii UW i IBB PAN) | |
| 13.05.03 | Globalna analiza interakcji czynników transkrypcyjnych u drożdży | Andrzej Jerzmanowski (Wydział Biologii UW i IBB PAN) oraz Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 06.05.03 | Bioinformatyka regulacji genów: przegląd prac z ostatnich konferencji RECOMB'2003 oraz Pacific Symp. Bioinf.'2003 | Jerzy Tiuryn (MIM UW) | |
| 29.04.03 | O złożoności problemów mapowania genomów | Jacek Błażewicz (Instytut Informatyki Politechniki Poznańskiej oraz Instytut Chemii Bioorganicznej PAN) | |
| 15.04.03 | Wybrane aspekty przewidywania struktury białek | Krzysztof Fidelis (Lawrence Livermore National Laboratory, USA) | |
| 01.04.03 | Stan przejściowy w białkach | Marek Cieplak (Instytut Fizyki, PAN) | |
| 25.03.03 | Hierarchiczna metoda przewidywania struktury białek w oparciu o kryteria energetyczne | Adam Liwo (Wydział Chemii Uniwersytetu Gdańskiego oraz Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej) | |
| 18.03.03 | Stochastyczne efekty w ekspresji genów | Andrzej Kierzek (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN, Warszawa) | |
| 11.03.03 | Jednolite podejście do przewidywania struktury białek | Andrzej Koliński (Wydział Chemii, UW) | |
| 25.02.03 | Analiza motywów rejonów promotorowych u Arabidopsis thaliana | Jerzy Dyczkowski (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) | |
| 18.02.03 | Regulatorowe RNA | Jan Barciszewki (Instytut Chemii Bioorganicznej PAN, Poznań) | |
| 07.01.03 | CASP5 -- modelowanie struktury białek w oparciu o podobieństwo sekwencyjne | Krzysztof Ginalski (ICM UW, BioInfoBank Institute) | |
| 17.12.02 | Repetitions in DNA sequences and algorithms for identifying them | Gregory Kucherov (INRIA/LORIA, Nancy, Francja) | |
| 10.12.02 | Rozpoznawanie białko - białko | Marian Siwak (Instytut Biochemii i Biofizyki, PAN) | |
| 03.12.02 | Wykrywanie horyzontalnego transferu genów | Paweł Górecki (Instytut Informatyki, UW) | |
| 19.11.02 | 3D-Jury, poprawianie jakości automatycznego przewidywania struktury białek | Leszek Rychlewski (BioInfoBank Institute, Pozna) | |
| 12.11.02 | Mechanizmy regulacyjne w procesie rozwoju | Andrzej Jerzmanowski (Wydział Biologii UW oraz Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) | |
| 05.11.02 | Zastosowanie informacji o strukturze białek do odtwarzania historii ewolucyjnej w "strefie zmierzchu" podobieństwa sekwencyjnego | Janusz M. Bujnicki (Miedzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, Warszawa) | |
| 29.10.02 | Zwijanie białek metoda lokalnych deskryptorów, cz. 2 | Szymon Nowakowski (Instytut Informatyki, UW) | |
| 22.10.02 | Zwijanie białek metoda lokalnych deskryptorów, cz. 1 | Michał Drabikowski (Instytut Informatyki, UW) | |
| 15.10.02 | Uliniowienie kontekstowe w filogenetyce | Anna Gambin (Instytut Informatyki, UW) |
